O
anime/
mangá conta a história de um menino chamado
Uzumaki Naruto, uma criança que vive na
Vila da Folha Oculta a vila ninja do
País do Fogo. Quando ainda bebê, Naruto teve um monstro aprisionado em seu corpo, o
Bijuu chamado
Kyuubi, pelo
Quarto Hokage, para salvar a vila. Desde então, Naruto é visto por muitas pessoas como um monstro, não só pelos familiares das pessoas mortas pela Kyuubi, mas também por pessoas que sofrem com as besteiras feitas por Naruto que é extremamente arteiro. Incompreendido, Naruto sonha em se tornar um ninja poderoso, e ser nomeado Hokage, para assim ser reconhecido por todos.
Ele entra na Academia Ninja, onde sofre com as notas baixas, mas é ajudado por seu professor e amigo
Umino Iruka. Consegue finalmente se tornar
Genin e a partir daí passa a ser ensinado pelo
Jounin Hatake Kakashi, e forma um trio com seus colegas,
Haruno Sakura e
Uchiha Sasuke. O anime/mangá, conta sobre as missões que Naruto e seus colegas devem cumprir e, mais tarde, o
Exame Chunnin, que selecionará aqueles que passarão para o segundo nível ninja.
Além de muitas outras aventuras que o jovem Uzumaki Naruto vai enfrentar, ele aprenderá novas técnicas e ficará mais forte e assim cada vez mais próximo de alcançar o seu sonho.